Docking molecular, dinámica molecular y diseño de primers para tu tesis, tu laboratorio o tu próximo fármaco.
Receptor µ-opioide humano (PDB 8EF5) con un ligando acoplado en el sitio ortostérico, −9.4 kcal/mol. Es uno de nuestros proyectos reales; arrástralo para girarlo.
Poses, interacciones y superficies listas para tu tesis o artículo.
Positivos y negativos en total, para que tus resultados tengan contra qué compararse.
Metodología, resultados y una discusión breve con mini revisión bibliográfica.
Sin costo extra, con asesoría para elegirlos si todavía no los tienes definidos.
Según cuántas dianas (proteínas objetivo) y cuántos ligandos quieras evaluar. Precios en pesos mexicanos.
Para estudiar a fondo una sola proteína.
1 diana, hasta 5 ligandos.
Ideal como primer acercamiento.
1 diana, hasta 10 ligandos.
Cribado ampliado de una sola diana.
1 diana, 15 ligandos en adelante.
Volumen alto, precio negociable.
Para comparar tus ligandos contra varias proteínas a la vez.
Cribado en 5 dianas, hasta 5 ligandos por diana.
Multi-diana, alcance medio.
Cribado en 10 dianas, de 5 a 10 ligandos por diana.
Multi-diana, alcance amplio.
Cuando tu proteína todavía no tiene estructura cristalográfica.
Modelado del receptor con AlphaFold2 y docking de hasta 5 ligandos. Incluye análisis de fiabilidad del modelo mediante análogos estructurales.
Modelado + docking en un solo paquete.
Para encontrar candidatos entre cientos o miles de compuestos.
Docking de una biblioteca completa contra tu diana: la tuya o productos naturales de la base abierta COCONUT. Te entregamos los mejores candidatos ordenados, con sus interacciones y figuras.
El precio depende del tamaño de la biblioteca.
Análisis extra que se suman a cualquier paquete.
Reglas de Lipinski y Veber, QED, alertas PAINS y accesibilidad sintética de tus ligandos.
Con RDKit
Una tabla y una figura por lote.
Detectamos y clasificamos los sitios de unión posibles cuando no se sabe dónde se une tu ligando.
Con fpocket
Ideal para proteínas poco estudiadas.
Geometría optimizada, cargas y orbitales HOMO-LUMO de tus ligandos.
Con xtb y Psi4
Útil para explicar la reactividad.
Validación por dinámica molecular sobre el complejo receptor-ligando, como complemento a tu paquete de docking.
Validación rápida de estabilidad.
Validación extendida de estabilidad.
Calculamos la ΔG de unión sobre la trayectoria de tu dinámica molecular, una estimación más confiable que el score de docking para ordenar tus ligandos. Requiere Rebozo Corto o Largo.
Rebozo Corto y Rebozo Largo se cotizan junto con el paquete de docking correspondiente; no lo sustituyen.
Diseñamos tus primers para PCR a partir de tu secuencia blanco, evaluando Tm, contenido GC, dímeros, horquillas, estructuras secundarias y especificidad. Todo con herramientas open source.
Docking de cortesía. Los diseños de primers de $800 MXN o más incluyen un docking molecular sin costo adicional.
El mismo flujo estandarizado y reproducible en cada proyecto.
Trabajos que hemos realizado para nuestros clientes. Explóralos en 3D.
Herramientas que diseñamos para enseñar y aprender química computacional, docking y biología molecular, gratuitas para estudiantes y profesores.
Para tu grupo de investigación, laboratorio o clase. Aprenden a hacer docking de principio a fin con herramientas libres, en sus propias computadoras.
Cuéntanos qué necesitas y te confirmamos alcance y precio por correo.